持有建筑二级建造师证书的个人可能会面临以下坏处：
注册资格撤销
如果二级建造师的注册资格存在问题，例如学历、工作经验等不符合要求，或者存在违规操作如挂靠、转借证书等情况，注册资格可能会被撤销。撤销注册资格意味着建造师将不能以注册建造师的身份从事相关工作，这将对个人的职业生涯产生严重影响，可能导致失业或需要转行。
罚款与法律责任
根据问题的严重程度，建造师还可能面临罚款或其他行政处罚。如果问题涉及到违法行为，如伪造证件、行贿等，建造师可能还需要承担相应的法律责任，包括民事赔偿甚至刑事责任。
行业禁入
在某些情况下，如果建造师的行为严重违反了建筑行业的规范和道德，他们可能会被行业组织列入黑名单，在一定时间内甚至永久禁止其再次进入建筑行业。这对个人的职业发展来说是一个沉重的打击。
影响个人信用
随着社会信用体系的建设，个人的职业行为也会影响到个人的信用记录。一旦建造师的行为被记入不良信用记录，可能会影响到贷款、就业、出国等多个方面。
企业风险
建造师如果通过中介或自己找到用证单位，可能会遇到一些糟心事，如企业风险、证书挂靠的企业风险等。例如，挂不到理想的城市，或者遇到不诚信的企业，可能会导致一系列问题。
安全风险
建造师挂靠存在安全风险，尤其是人证分离挂靠项目。虽然现在政府对于建造师在项目上任项目经理或者投标需要本人亲自到现场的管理越来越严格，但仍有安全风险。此外，证书丢失、被其他单位抢先注册等也会带来风险。
政策法规风险
政策法规的变化可能会对建造师产生不利影响。例如，政府对于建造师挂靠的管理越来越严格，可能会导致挂靠的成本增加或变得不可能。
综上所述，持有建筑二级建造师证书的个人应当严格遵守相关法律法规，避免违规操作，以维护自己的职业生涯和信用记录。同时，选择诚信的企业合作，确保自己的权益不受损害。