监理工程师考试中最难的科目是 《建设工程监理案例分析》。在监理工程师考试中，共有四个科目，包括《建设工程合同管理》、《建设工程目标控制》、《建设工程基本理论与相关法规》和《建设工程监理案例分析》。其中，《建设工程监理案例分析》被普遍认为是难度最大的科目。
案例分析科目需要考生将其他几个科目的知识进行综合运用和灵活应用，涉及实际案例的分析、问题的解答和决策，这要求考生具备较强的综合能力和实际操作能力。此外，案例分析与实际工作密切相关，需要考生具备扎实的理论基础、丰富的实践经验，并能够熟练掌握相关法规和规范。
尽管其他科目如《建设工程目标控制》和《建设工程基本理论与相关法规》也有一定的难度，但相比之下，案例分析科目的难度更高，需要考生全面掌握各科知识，并能够灵活运用。
因此，建议考生在备考过程中，将《建设工程监理案例分析》作为重点和难点进行攻克，同时加强其他科目的学习和练习，以提高整体考试通过率。