总监理工程师的制度主要包括以下几个方面：
项目总监理工程师负责制
项目总监理工程师代表公司，依据《委托监理合同》，对全过程进行管理。
项目目标管理责任书
工程中标后，总监理工程师需与公司签订《项目目标管理责任书》。
考核制度
公司依据项目管理办法，对项目的经济指标、服务质量、安全生产、项目管理水平等四项指标进行考核，确定总监理工程师和其他人员的工资、奖金。
质量责任
总监理工程师对监理项目部所有监理人员的质量行为和事件负相应领导责任。
监理规划和实施细则
全面履行监理合同中质量和技术工作，主持编写项目监理规划，审批项目监理实施细则。
人员管理和调配
检查和监督监理人员的工作，考核其职责履行情况，根据工程进展进行人员调配，建议对不称职的人员进行调换。
会议制度
主持监理工作会议，签发监理项目部的文件和指令。
审查和监督
审定施工单位提交的开工报告、审查施工组织设计、技术方案、进度计划。
按规定审查和处理工程变更和工程索赔。
事故调查和总结
主持或参与工程质量事故的调查，组织编写并签发监理月报、监理工作阶段报告、专题报告和项目监理工作总结。
上班制度
项目总监理工程师需要每天按时到岗，并在规定时间内完成工作任务，严格遵守工程进度和质量要求。
责任制度
总监理工程师是建设工程项目中监理机构的负责人，主要职责包括协调监理机构与业主、承包商之间的关系，监督工程进度，审查工程设计和技术文件，提出工程质量问题和解决方案等。
这些制度旨在确保总监理工程师在工程项目中能够全面、规范、细致地进行监督管理，保证工程质量和安全，提高监理人员的工作效率和工作质量。