如果您的安全工程师合格证丢失了，可以按照以下步骤重新申请：
报告丢失情况
第一时间联系颁发证书的机构，向他们报告证书丢失的情况，并咨询具体的补办流程和所需材料。
提交补办材料
向当地安全生产监管部门提交《安全生产工作人员证书申请表》，并加盖单位公章。同时提供身份证明、学历证明等相关材料。
提交遗失声明、身份证复印件、登报声明原证书作废的报纸等材料。
缴纳费用
根据当地安全生产监管部门的要求，缴纳相关费用。
等待审核
提交所有材料后，等待安全生产监管部门的审核。审核通过后，您可以到指定地点领取新的安全工程师合格证。
注意事项
在重新申请证书期间，您可能需要支付一定的费用，具体费用可以咨询颁发证书的机构。
丢失证书后，应及时向当地公安机关报案，以防止他人利用您的证书进行不法活动。
建议您尽快联系颁发证书的机构，获取详细的补办指南，并按照要求准备所有必要的材料，以确保补办过程顺利进行。