监理工程师的控制措施主要包括以下几个方面：
合同措施
合同的签订、履行、变更和索赔处理。
协助业主确定工程承发包模式和合同结构。
拟订合同条款、参加合同谈判、处理合同执行过程中的问题以及防止和处理索赔工作。
组织措施
建立健全项目监理机构，完善职责分工，制定质量监督制度，落实质量控制责任。
明确项目总监理工程师负责制，各岗位职责分明，订立明确的目标和岗位责任。
协调内部需求关系，平衡人员、材料、设备、能源动力需求，制定计划并严格按照计划执行。
技术措施
协助完善质量保证体系，严格事前、事中和事后的质量检查监督。
采用旁站、巡视、平行检验、测量等监理手段，确保施工过程中的质量控制。
对施工工艺、材料、设备等进行严格检查和测试，确保符合设计要求和相关标准。
经济措施
严格质检和验收，不符合合同规定质量要求的拒付工程款。
按合同支付质量补偿金或奖金，激励承包商提高工程质量。
协议措施
强化施工单位做好开工前各项准备工作，保证监理工程师的核心地位。
通过工地例会等形式，定期召开由有关单位参加的相关会议，协调工程质量、造价、进度、合同管理等事宜。
个人专业水平和实践能力
监理工程师需要具备全面的专业知识，能够对工程质量、进度、安全、投资等方面进行全方位的监督管理。
定期进行专业知识培训，提升个人实践能力，以适应不断变化的工程需求。
这些措施共同构成了监理工程师在工程项目中的控制体系，旨在确保工程按照既定的质量、进度和成本要求顺利完成。