造价工程师在处理变更工程结算时，应遵循以下步骤和方法：
理解工程变更
准确理解工程变更的含义及范围，包括工程量增减、工程项目取消、工程质量、性质或类型的改变等。
合理计价
针对变更部分，采用正确的计价方法进行合理计价。这包括根据变更内容重新计算工程量，选用合适的计价依据和标准，确保变更部分的结算价格客观、公正。
确定变更工程结算价值
原施工合同范围内的变更：
若在工程量清单中已列明的单价，变更工程的单价可按投标报价书中相应的单价作为结算单价，再按双方认可的变更工程量计算确定结算价值。
若工程量清单中未列明变更工程的单价，应根据施工中双方签认或协商一致的工程变更单价，按实际完成变更工程量确定结算价值。
若工程量清单中未列明且双方协商未确定的工程变更单价，应依据造价工程师参考类似工程定价方法确定的单价，按实际完成变更工程量计算确定结算价值。若承包商对变更工程结算价确定存在疑问，可向业主提出变更工程索赔。
原合同范围以外的变更：
若变更工程性质和内容与原工程合同完全相同，则工程变更结算单价可以采用原合同单价或投标报价书中的相应单价，确定变更工程结算单价，按实际完成变更工程量确定结算价值。
若变更工程性质和内容与原工程承包合同性质、内容完全不同，则应由业主与承包商另签新的合同文件，重新协商确定变更工程的合同价值，按新增工程结算。
审核流程
遵循工程结算和竣工决算的审核流程，确保每一步的审核都有据可查，公开透明。
变更审批
工程变更和合同价款的审批应严格按照合同条款和相关规定执行。任何变更都需要得到业主和监理工程师的确认，并以书面形式（如工程变更令）为依据。
反映实际情况
在处理结算问题时，要确保变更工程结算能够恰当地反映工程投资实际情况，避免因处理不当导致投资失控。
使用专业软件
利用造价管理软件和工程预算系统，提高工程结算的准确性和效率。
规范变更签证流程
建立严谨规范的流程，当工程中出现变更需求时，必须由相关方提出正式的变更签证申请，申请内容要涵盖变更原因、详细变更内容、对工程质量、进度和造价的预估影响。
通过以上步骤和方法，造价工程师可以确保变更工程结算的准确性和公正性，同时也有助于避免工程结算中的造价纠纷问题。