造价工程师的管理主要涉及以下几个部门：
住房城乡建设部：
负责全国造价工程师的注册管理信息库的建立，促进造价工程师注册、执业和信用信息共享，并负责一级造价工程师的注册及相关工作。
交通运输部：
按照职责分工，负责交通运输行业内的造价工程师注册及相关工作。
水利部：
按照职责分工，负责水利行业内的造价工程师注册及相关工作。
各省、自治区、直辖市住房城乡建设、交通运输、水利行政主管部门：
根据职责分工，分别负责本行政区域内造价工程师的注册及相关工作。具体到二级造价工程师的注册，也由这些部门按专业类别分别负责。
此外，国务院建设行政主管部门（或省级人民政府建设行政主管部门）还负责造价工程师的注册和执业活动的监督管理，包括对不正当手段取得注册证书等违法违规行为的撤销。
综上所述，造价工程师的管理涉及多个层级和部门的协同工作，以确保造价工程师的专业素质和执业行为的规范性。