监理工程师的指示通常包括以下内容：
变更内容：
监理工程师需要详细说明变更的具体内容，包括变更的部分、变更后的设计要求等。
变更工程价款：
监理工程师应指示变更工程的价格调整，包括变更导致的新增成本和减少成本。
变更项目的施工技术要求：
监理工程师需要提供变更项目的施工方法、工艺流程等技术要求，确保施工符合相关标准和规范。
有关图纸文件：
监理工程师应提供变更所需的图纸、设计文件等，以便施工人员进行施工。
变更处理的原则：
监理工程师需要明确变更处理的原则和方法，包括变更的审批流程、责任分配等。
此外，从管理层次上分，监理指令还可以包括对总承包人、指定分包人的指令和总监理工程师对下属监理的指令。从指令的内容上分，有工程质量控制、工程进度控制、工程投资控制、工程合同管理以及其他方面的指令。
综上所述，监理工程师的指示是确保工程顺利进行的重要环节，应明确、具体，并符合相关法规和合同条款的要求。