注销水利工程监理工程师的流程如下：
准备材料
身份证原件及复印件
水利监理工程师证书原件及复印件
填写好的注销申请表
监理工程师执业印章（如适用）
提交申请
将以上材料带到当地水利主管部门，填写注销申请表并提交。
可以通过水利部政务服务平台进行网上申请。
审核过程
水利主管部门会对申请进行审核，审核通过后会注销水利监理工程师资格，并收回证书。
工作人员会对申请材料进行审核，如无问题，会安排注销手续。
领取注销证明
注销手续完成后，水利主管部门会出具注销证明，监理工程师需要前往领取。
注意事项
注销后，水利监理工程师将不再能够从事监理工作，也不能向其他机构和人员提供任何建议或意见。
在某些情况下，注销的监理工程师可能会受到法律的严惩。
建议：
提前准备好所有必要的材料，确保材料的真实性和完整性。
仔细填写注销申请表，并详细说明注销原因。
提前咨询当地水利主管部门，了解具体的办理流程和可能遇到的问题。