对工程总监理工程师的处理措施可以根据具体情况和相关法律法规进行，主要包括以下几个方面：
警告和记过：
对于工作失误、违反规定或职业道德不端的情况，可以给予警告或记过处分。
罚款：
根据违规行为的严重程度，可以处以不同金额的罚款。
降职或开除：
对于工作表现不佳、管理能力不足或职业素养低下的总监理工程师，可以给予降职或开除处分。
暂停或吊销执业资格证书：
若因总监理工程师未在岗位上导致事故发生，或者存在严重违规行为，可能会被暂停或吊销其与监理工作相关的所有资格证书。
刑事责任：
在情节特别严重的情况下，可能会触犯刑法，需要按照相关法律法规追究其刑事责任。
内部监督机制：
建立健全的内部监督机制，增加监督力度，对于重大工程建设，要建立专业审查机制，设立监理部门和监察机构，严格把关工程建设质量。
责任追究：
对于未能严格履行监理职责，造成人员死亡和经济损失的总监理工程师，除了上述处罚外，还可能面临停止执业、吊销执业资格证书等严厉处罚。
奖励机制：
对于在工程项目中表现优秀、做出重要贡献的总监理工程师，可以给予表彰奖、奖金或晋升等激励措施。
在处理工程总监理工程师时，应依据具体情况和法律法规，公正、权威地做出判断，确保工程建设质量和良好社会形象。同时，要注重人的因素，注重细节和安全，确保项目的成功。