消防工程师管理办法并未作废。
消防工程师是在中华人民共和国公安部消防局通过考试取得相应的执业资格，从事消防安全技术工作的专业技术人员。只有通过考试并取得相应的证书，才能具备执业资格，并且不存在作废的说法。
尽管政策方面有所变动，例如取消了部分考试科目，调整了报考条件等，但这些改革旨在提高消防工程师的整体素质和业务能力，并不意味着消防工程师资格作废。实际上，消防工程师资格依然具有实际意义和价值，仍然是一个重要的职业，且在消防安全领域具有不可替代的作用。
此外，根据相关规定，某些特定情形下，注册消防工程师的注册可能会被注销，例如不具有完全民事行为能力、年龄超过70周岁、未延续注册超过三个月、被撤销注册或吊销注册证等，但这些情况并不等同于消防工程师资格作废。
综上所述，消防工程师管理办法并未作废，依然有效。