在建设工程中，若总监理工程师因故不能继续履行职责，会涉及到监理工程师指令的变更。以下是变更监理工程师指令的相关要点：
变更指令的发出
总监理工程师因故不能继续履行职责时，会由建设单位或监理单位发出变更指令，明确变更后的监理工程师和相关事宜。
变更内容
变更指令应包括变更原因、变更内容、变更时间、变更后的监理工程师等信息。这些信息对于确保工程顺利进行至关重要。
文件要求
承包商在接到变更指令后，需在规定时间内以书面形式向项目监理机构提出相关文件，包括工程变更单和工程变更估算表。
承包商还需对变更引起的费用及工期进行报审，相关文件需在接到变更指令后的一定时间内提交给项目监理机构审批。
费用及工期补偿
业主不对承包商因变更而发生的任何费用及工期进行补偿。承包商需自行承担变更引起的费用及工期，并在规定时间内提交相关计算书以供审批。
合法性和合规性
监理工程师变更令的发出和执行需严格遵守相关法律法规，确保变更过程的合法性和合规性。
建议在实际操作过程中，各方应严格按照变更指令的要求进行沟通和执行，确保工程管理的规范性和有效性。