如果您的二级建造师磁卡丢失了，可以按照以下步骤进行补办：
立即向考试中心或颁发证书的部门申请遗失补办。您需要携带身份证、二级建造师证书以及相关证书复印件，并填写一份二级建造师信息卡遗失申请表，表格中需要填写详细的个人信息，包括姓名、身份证号码、联系方式等。
支付补办费用。不同考试中心和颁发部门，补办费用的标准有所不同，通常情况下，补办一张二级建造师信息卡的费用比较低，可以在100元左右。如果同时丢失了二级建造师证书，需要再支付一定的证书补办费用。
准备其他必要材料。根据当地建设行政主管部门的要求，您可能还需要提供其他材料，如公司出具的丢失证明、报案回执、刊登遗失声明的报纸原件等。
提交补办申请。携带上述准备好的材料，前往当地住房和城乡建设部门提交补办申请。部分地区可能支持线上申请，请关注当地住建部门官方网站或咨询工作人员。
等待审批并领取新卡。住建部门会对提交的申请进行审核，审核通过后，会通知领取新的证件。领取新卡时，需要核对信息，确认无误后签字。
建议您尽快办理补办手续，以免影响工作进度和造成不必要的安全风险。