监理工程师结论的签署应当遵循以下步骤和原则：
项目完成后的全面检查和评估
监理工程师应在工程项目完成后，进行全面的检查和评估，确保工程项目符合法律法规和相关标准规定。
签署合格结论
如果工程项目符合要求，监理工程师应签署合格结论，并向业主和建设单位发出监理报告。在签署合格结论前，应确保所有相关文件和资料齐全，并由项目经理和承包单位签字盖章。
提出改进措施
如果工程项目存在问题，监理工程师应提出合理的改进措施，并要求建设单位进行整改。在整改完成后，应重新进行验收，并签署相应的结论。
详细说明工程状况和问题
监理工程师应在监理报告中详细说明工程项目的质量状况和存在的问题，并提出具体的建议和意见。这有助于业主和建设单位了解工程项目的实际情况，并为后续工作提供依据。
审核和签认
总监理工程师应对专业监理工程师的审查意见进行审核。如果同意专业监理工程师的审查意见，应签署“同意按该施工组织设计/（专项）施工方案组织施工”；如果不同意，应简要指明不同之处，并签署修改意见。最终结论应由总监理工程师签认。
验收结论
在检验批报审表上，监理工程师应根据验收情况填写“合格”或“不合格”，并签署监理工程师姓名及时间。如果验收不合格，应要求施工单位整改合格后再报。
沟通和确认
在签署意见前，监理工程师应与建设单位的工作人员进行沟通，了解最新的项目情况，确保签署的意见符合双方的要求。此外，监理工程师应将监理意见书交给业主和施工单位，并要求他们在意见书上签字确认。
存档和备份
监理工程师应将签署后的监理意见书复印件保留在监理档案中，以备后续使用。这有助于确保监理工作的透明度和可追溯性。
综上所述，监理工程师在签署结论时，应确保工程项目符合要求，提出合理的改进措施，并在监理报告中详细说明工程状况和问题。同时，监理工程师应遵循相关法律法规和合同约定，确保签署的意见真实有效，并妥善保存相关文件资料。