安全工程师指导手册的内容通常涵盖以下几个方面：
施工前HSE管理体系的建立
了解生活、办公、工程概况，包括工程所在地的地理环境、社会依托、气象条件等。
获取法律法规及相关方的HSE要求。
建立项目部健康、安全、环境组织机构，确定关键人员。
人员能力评价。
制订HSE培训计划。
健康安全环境职责分配。
健康安全危害、环境因素识别与评价。
确定项目部健康安全环境目标和指标。
制定关键人员及各部室的HSE职责。
制定风险控制和削减措施。
制定应急预案及培训、演练计划。
制定监测计划。
施工中HSE管理
关键人员资质收集及报检。
入场安全教育培训。
现场HSE宣传策划。
现场HSE设施策划。
机具设备的有效性确认。
作业许可证的管理。
HSE会议。
HSE检查。
隐患整改通知及回复。
安全技术交底。
健康安全环境奖励及惩罚。
健康安全环境工作报表。
工作危险性分析。
事故分类与报告。
工伤保险办理。
HSE资料的归档
收集和整理施工过程中产生的所有HSE相关文件资料，确保资料完整、准确。
施工结束后HSE统计工作
对施工过程中的HSE管理工作进行总结和统计，分析存在的问题，提出改进措施。
此外，手册还可能包括以下内容：
安全工程师的职责和权利。
安全生产法律法规和标准。
安全生产管理流程和操作规程。
安全生产风险评估和应急响应计划。
安全培训和教育计划。
安全设施和设备的管理和维护。
事故处理和调查。
安全奖惩机制。
这些内容旨在帮助安全工程师在施工过程中全面履行其职责，确保工程项目的健康、安全和环境管理得到有效实施。手册应根据具体工程项目的实际情况进行编制，以确保其针对性和实用性。