管理消防工程师的方法主要包括以下几个方面：
积分管理
根据天津市消防救援总队发布的《天津市消防技术服务机构及从业人员积分管理办法》，消防技术服务机构聘请的一级注册消防工程师和消防设施操作员可以获得积分。具体积分规则为：每多聘请1名一级注册消防工程师，机构可加2分，最多加14分；每多聘请1名高级消防设施操作员，机构可加2分，每多聘请1名中级消防设施操作员，机构可加1分，最多加6分。这些积分将随人员变动实施动态管理。
成绩管理
一级注册消防工程师资格考试成绩实行3年为一个周期的滚动管理办法。报考全部科目的考生需要在连续的3个考试年度内参加应试科目的考试并合格，方可取得一级注册消防工程师资格证书。参加2个科目考试（级别为免一科）的应试人员必须在连续2个考试年度内通过应试科目，方可取得资格证书。
注册管理规定
根据《注册消防工程师管理规定》，取得注册消防工程师资格证书的人员需要进行注册、执业和继续教育。注册消防工程师在注册有效期内，需要定期参加继续教育，并在规定时间内完成规定的继续教育课程。
行政管理
消防工程师需要通过制定消防方案、监督施工现场、组织消防演练、定期检查消防设施等方式进行管理，确保安全第一，预防为主。
技术管理
注册消防工程师在建筑消防设计、施工、验收以及日常维护管理等方面发挥专业技术力量，确保建筑物的火灾安全性，防止火灾事故的发生，并在火灾发生时能够及时响应和处置。
质量管理
通过制定和执行消防管理制度、标准和操作规程，确保消防服务的质量和效果。
综上所述，管理消防工程师需要综合运用积分管理、成绩管理、注册管理规定、行政管理、技术管理和质量管理等多种手段，以确保消防服务的专业性、规范性和有效性。