二级建造师申请失效可能由以下几种情况导致：
证书有效期届满未延续
二级建造师资格证书通常有一定的有效期，例如可能为三年。持证人需要在证书到期前按照规定程序申请延续注册。如果持证人在证书有效期届满后没有进行延续注册，那么其证书将自动失效。
未按规定参加继续教育
为了保持专业水平和适应行业发展，二级建造师需要定期参加继续教育。如果持证人未按规定完成继续教育的学时要求，其证书也可能被宣布失效。
违反职业道德或执业规范
如果二级建造师在执业过程中违反了相关的职业道德或执业规范，例如存在严重的质量问题或者违规行为，相关管理部门可以取消其注册资格，从而导致证书失效。
年龄限制
根据相关规定，二级建造师在达到一定年龄后可能需要退休，此时其证书也将失效。具体年龄限制因地区而异，需参照当地的具体规定。
其他法定情形
除了上述情况外，还可能存在其他一些法定情形导致二级建造师证书失效，如个人申请注销注册等。
违规操作导致的处罚
如果二级建造师在执业过程中存在违法行为，如伪造资质、参与不正当竞争等，可能会受到行政处罚，包括但不限于吊销证书。
企业原因
在某些情况下，如果二级建造师所在的公司因为某些问题（如重大安全事故）被取消了相应的资质，那么该公司的所有二级建造师证书都可能受到影响，从而失效。
个人主动放弃
持证人也可以选择主动放弃其二级建造师资格，这通常发生在持证人转行或不再从事相关行业的情况下。这种情况下，持证人需要按照规定的程序办理证书的注销手续。
建议
及时延续注册：持证人应在注册有效期届满前30天内提出延续注册申请，并提供相应的证明材料，如继续教育证明、执业业绩证明等。
完成继续教育：持证人应定期参加继续教育，并通过考核，以保持其专业水平和业务能力。
遵守职业道德和执业规范：在执业过程中，应严格遵守相关法律法规和职业道德规范，避免因违规操作而导致证书失效。
及时更新个人信息：如果二级建造师的个人信息发生变化，应及时向注册机构报告并更新信息，以避免因信息不准确而导致注册失效。
通过以上措施，可以有效避免二级建造师注册失效的风险。