安全工程师特种作业的重点主要包括以下几个方面：
风险辨识与安全教育
作业前应对作业现场和作业过程中可能存在的危险、有害因素进行辨识，并制定相应的安全措施。
对参加作业的人员进行安全教育，并进行书面安全技术交底，确保所有人员签字记录在案。
作业审批手续
作业前需办理作业审批手续，并由相关责任人签名确认，确保作业合法合规。
工艺处理与防护用品
作业前应对设备、管线进行隔绝、清洗、置换，并确认满足动火、进入受限空间等作业安全要求。
进入作业现场的人员应按规定着装及正确佩戴相应的个体防护用品，多工种、多层次交叉作业应统一协调。
应急机制
当作业现场出现异常，可能危及作业人员安全时，作业人员应立即停止作业，迅速撤离，作业单位应立即通知生产单位。
现场恢复
作业完毕后，应恢复作业时拆移的安全设施的安全使用功能，并及时撤离作业用的工器具、脚手架、临时电源、临时照明设备等，同时清理现场废料、杂物、垃圾、油污等。
动火作业
动火作业前应进行气体分析，确保动火点周围及其下方的可燃物、电缆桥架、孔洞等采取清理或封盖等措施。
动火作业实行“三不动火”原则，即没有经批准的动火作业许可证不动火、动火监护人不在现场不动火、安全管控措施不落实不动火。
在用火前应清除现场一切可燃物，并准备好消防器材。用火期间，距用火点30m内严禁排放各类可燃气体，15m内严禁排放各类可燃液体，也不可进行装卸作业。在同一动火区域不应同时进行可燃溶剂清洗和喷漆等施工。
临时用电作业
安装临时用电线路的电气作业人员应持有电工作业证。
临时用电电源施工、安装应严格执行电气施工安装规范，并接地良好。
在防爆场所使用的临时电源，电气元件和线路应达到相应防爆等级要求，并采取相应的防爆安全措施。
临时用电线路及设备的绝缘应良好，与锐利金属接触摩擦部应加护套管。
临时用电架空线应采用绝缘铜芯线，架空线最大弧垂与地面距离在施工现场不低于2.5m，应架设在专用电杆上，严禁架设在树木和脚手架上。
对现场临时用电配电盘、箱有编号，并有防雨措施，盘、箱、门能牢靠关闭。行灯电压不应超过36v，在特别潮湿的场所或金属设备作业装的临时照明行灯电压不应超过12v。
其他特种作业
特种作业还包括高处作业、制冷与空调作业、煤矿安全作业、金属非金属矿山安全作业、石油天然气安全作业、冶金（有色）生产安全作业、危险化学品安全作业、烟花爆竹安全作业等。这些作业的发证机关为应急管理部门。
这些重点内容涵盖了安全工程师在特种作业中需要关注的关键环节，确保作业过程的安全可控。