船舶监理工程师的考试科目主要包括以下几门：
《建设工程监理基本理论和相关法规》：
这门科目主要考查考生对监理基本理论、法律法规及合同管理的理解与应用能力。内容较为广泛，包括相关法律法规、标准以及合同示范文本等。考试题型全部为选择题。
《建设工程合同管理》：
这门科目主要涉及合同把控管理的相关知识，包括相关法律、招标、合同管理、国际合同文本等内容。考试题型全部为选择题。
《建设工程目标控制》：
这门科目主要考查考生在工程投资、进度和质量控制方面的能力。考试题型为客观选择题。
《建设工程监理案例分析》：
这门科目通过案例分析的形式，考查考生运用监理工程相关专业知识解决实际问题的能力。考试题型包括主观题和客观题。
综上所述，船舶监理工程师的考试科目共四门，包括两门基础科目和两门专业科目，分别是《建设工程监理基本理论和相关法规》、《建设工程合同管理》、《建设工程目标控制》和《建设工程监理案例分析》。