监理工程师的利益分配应当遵循以下几个原则：
公平原则：
确保所有监理人员按照其工作性质、职责和贡献获得相应的报酬，避免出现不公平的现象。
激励原则：
通过合理的薪酬结构和绩效考核，激励监理人员积极工作，提高工作效率和质量。
科学原则：
根据项目规模、复杂程度、工作量和人员的专业能力等因素，科学合理地分配监理资源。
透明原则：
分配过程应公开透明，确保所有相关方都能够了解分配标准和结果。
具体分配方法可以参考以下几种：
岗位工资制：
根据监理人员的岗位等级确定基本工资，岗位越高，工资越高。同时，结合出勤天数、年功工资、职务津贴等构成薪酬体系。
绩效考核制：
设定绩效考核指标，对监理人员进行定期考核，根据考核结果分配绩效奖金。考核结果可以划分为优秀、良好、合格、基本合格和不合格等档次，对应不同的奖金分配额度。
项目分配制：
根据项目的具体需求和特点，将监理资源分配给具备相应专业知识和经验的人员。项目类型不同，所需的专业知识和经验也不同，因此分配时应充分考虑人员的背景和能力。
特殊贡献奖励：
对于在项目中做出特殊贡献或受到业主管理层、政府主管部门特别表彰的人员，可以由总经理给予特别奖励，以激励更多优秀人员。
通过以上方法，可以建立一个科学、合理、规范的监理工程师利益分配体系，从而调动监理人员的工作积极性，实现项目管理的目标。