安全工程师和安全员A证 不能互相代替。两者是不同的职业资格，具有不同的认证作用。
性质不同
安全工程师是专业技术人员资格，需要参加全国统考，属于应急管理部负责。
安全员A证是安全管理人员资格证，一般由当地住建委组织培训考试，属于建设部门负责。
职责不同
安全工程师负责安全生产的管理和监督，具有更广泛的使用范围，涵盖所有行业，特别是在高危行业。
安全员A证主要用于证明个人具备从事安全生产管理工作的资格，是项目经理必须具有的安全上岗证。
认证机构不同
安全工程师的认证由应急管理部负责。
安全员A证的认证由建设部门负责。
综上所述，安全工程师和安全员A证不能互相代替，因为它们分别属于不同的职业资格认证体系，具有不同的职责和认证机构。