监理工程师企业操作流程主要包括以下几个阶段：
施工准备阶段
签订监理合同：建设单位与监理单位签订工程监理合同，明确双方的权利和义务。
组建项目监理机构：监理单位根据监理合同的要求，组建项目监理机构，确定总监理工程师、专业监理工程师和监理员等人员组成。
熟悉工程建设文件：监理人员熟悉工程建设的相关文件，包括设计文件、施工图纸、施工合同、招投标文件等，了解工程的基本情况和建设要求。
审查施工单位资质：审查施工单位的营业执照、资质证书、安全生产许可证等资质文件，确保施工单位具备相应的施工能力和资质。
审查施工组织设计和专项施工方案：审查施工单位编制的施工组织设计和专项施工方案，包括施工进度计划、施工方法、质量保证措施、安全保证措施等，确保施工方案合理、可行。
参加第一次工地会议：参加由建设单位主持的第一次工地会议，介绍项目监理机构的人员组成、监理工作范围和内容、监理工作程序和方法等，与建设单位和施工单位进行沟通和协调。
施工阶段
质量控制：审查施工单位的质量管理体系和质量保证措施，确保施工单位能够有效地控制工程质量。对进场的原材料、构配件和设备进行检验和验收，确保其质量符合设计要求和相关标准规范。对施工过程中的关键工序和隐蔽工程进行旁站监理，确保施工质量符合要求。对施工单位的检验批、分项工程、分部工程和单位工程进行验收，确保工程质量符合设计要求和相关标准规范。
进度控制：审查施工单位编制的施工进度计划，确保其合理、可行。对施工进度进行跟踪和检查，及时发现和解决进度偏差问题。
投资控制：审查工程投资计划，控制工程投资在批准范围内。参与工程计量和支付工作，确保工程费用合理使用。
协调会议纪要签发：定期召开监理例会，签发会议纪要，记录会议讨论的重要事项和决定，确保各方按会议决定执行。
图纸会审及技术交底：组织图纸会审，确保各专业图纸之间无矛盾，布置合理。对施工人员进行技术交底，确保施工人员理解设计意图和要求。
保修阶段
工程竣工质量验收：参与单位工程竣工预验收和总体工程竣工验收，审查竣工资料，确保工程质量符合设计要求和相关标准规范。
监理工作总结：编写监理工作总结，总结监理工作中的经验教训，为今后的监理工作提供参考。
监理资料归档：整理监理资料，包括合同、文件、会议纪要、验收记录等，归档保存。
以上是监理工程师企业的主要操作流程，具体操作过程中还需根据工程实际情况进行调整和完善。