注册监理工程师在注册有效期内（一般为3年）的转注次数限制如下：
一年内转注次数不得超过两次。根据《注册监理工程师管理规定》，注册监理工程师在一年内的转注次数不得超过2次。
初始注册后一年内不能转注。监理工程师在初始注册后的一年内不能进行转注，必须工作满一年才能进行变更注册。
转注需要提交相关材料。在转注时，需要提交包括但不限于原聘用单位的解聘证明、新聘用单位的聘用合同等相关材料，具体要求需咨询当地建设行政主管部门。
综上所述，注册监理工程师在注册有效期内，一年内可以转注两次，且初始注册后需满一年才能转注。建议在注册有效期内合理安排转注时间，以确保符合相关规定。