如果二级建造师毕业学校填写错误，可以采取以下步骤进行处理：
及时联系报名机构
一旦发现毕业学校填错，应立即联系当地人事考试中心或报名机构，说明情况。
提交相关证明材料
提供以下证明材料：
毕业证书原件及复印件。
学校出具的名称变更证明（如果毕业学校在考生报名后进行了名称变更）。
错误填写申请修改证明等。
按照流程申请修改
提交证明材料后，按照报名机构或人事考试中心的要求填写相关申请表格，并按照流程进行申请修改。
确认修改结果
及时跟进申请进度，确认学校信息是否已经成功修改。
建议
尽早处理：发现错误后应尽早联系报名机构，以免错过修改时间。
准备充分：确保所有相关证明材料齐全，以便顺利办理修改手续。
咨询确认：在正式提交申请前，可以电话咨询相关机构，确认所需材料和流程，确保万无一失。
通过以上步骤，一般是可以更正毕业学校信息的。