重庆二级建造师遗失后补办流程如下：
提交补办申请
携带身份证原件及复印件、遗失声明（需写明姓名、身份证号码、证书编号等信息，并声明该证书作废）、一寸蓝底或红底证件照片若干张，到重庆市建设执业资格注册中心提交补办申请。
准备材料
需要准备的材料包括：注册建造师注册证书补办或更换申请表、身份证明、遗失作废声明。
审核
工作人员将对提交的材料进行审核，确认无误后，将在一定工作日内完成审核。
缴费
根据相关规定，补办证书需要缴纳一定的工本费。
制证与领取
审核通过后相关部门会根据提供的信息制作新的二级建造师证书。制作完成后，申请人或其代理人可凭收据至指定地点领取新证书。
注意事项：
遗失证件的二级建造师需要先到当地公安局报案，取得报案证明。
补证的时间大概需要3到5个工作日，建议提前做好证件的备份。
在证书颁发时仔细核对各项信息，如姓名、身份证号等，以确保证件信息的准确性。
若遗失了本人的身份证，办理的手续将更加繁琐，需要提供更多的证明文件。
补办流程可能因地区或具体操作细节有所变化，建议直接咨询当地的建设行政主管部门或职业资格认证中心获取最新信息。
请按照上述步骤操作，如果有任何疑问，可以联系当地的建设行政主管部门或职业资格认证中心获取帮助