单位倒闭后，消防工程师的注销流程通常包括以下几个步骤：
提交书面离职申请
消防工程师需要向所在单位提交书面离职申请，说明离职原因和意愿。
单位审批通过
单位收到离职申请后，需要进行审批。审批通过后，单位会出具相关证明文件。
办理工作交接
在离职前，消防工程师需要与单位其他员工进行工作交接，确保工作顺利进行。
上交相关资格证书
消防工程师需要将注册证、执业印章等相关资格证书上交至原发证机构。
办理注销手续
最后，消防工程师需要到原发证机构办理注销手续，完成注销流程。
需要注意的是，如果聘用单位破产、解散、被撤销或被注销消防技术服务机构资质，消防工程师的注册资格将被注销，且注册证、执业印章或公告作废。在这种情况下，消防工程师需要按照相关规定，向原发证机构提交恢复资格的申请，并提供相关证明材料，如培训证明、工作经验证明等，以重新获得注册资格。
建议您尽早联系原发证机构，了解具体的注销和重新注册流程，以确保顺利过渡。