监理工程师在计量工程项目时，应当注意以下几点：
工程量清单中的全部项目：
监理工程师通常需要计量工程量清单中列出的所有项目，这些项目是按照合同要求应当完成的工作内容。
合同文件中规定的项目：
除了工程量清单中的项目外，监理工程师还需计量合同文件中明确规定的项目。这些项目可能包括特定的工程任务、材料要求或其他与合同条款相关的内容。
工程变更项目：
如果工程在实际施工过程中发生了变更，监理工程师需要对这些变更项目进行计量。这可能包括对原有工程量的调整、新增项目的添加或删除等。
有缺陷工程的工程量：
通常情况下，有缺陷的工程是不予计量的，除非这些缺陷是在合同允许的范围内，并且已经按照合同要求进行修复。
承包人原因导致返工的工程量：
由于承包人自身原因导致的返工工程量，通常是不予计量的。只有当返工是在合同允许的范围内，并且按照合同要求进行的情况下，才可能进行计量。
综上所述，监理工程师应当计量的项目主要包括：
工程量清单中的全部项目
合同文件中规定的项目
工程变更项目
建议在实际工作中，监理工程师应当严格按照合同条款和工程规范进行计量，确保计量的准确性和公正性。同时，对于承包人提出的任何变更请求，都应当仔细审查，确保变更符合合同要求，并进行适当的计量。