由于监理工程师指令有误导致施工现场停止施工，施工单位可以采取以下措施：
立即与监理工程师联系
施工单位应首先与监理工程师进行沟通，明确指出错误指令导致的停工情况，并要求监理工程师及时修改错误指令并提供解决方案。
通知相关管理部门和业主
施工单位还应及时通知工程项目的相关管理部门和业主，确保信息的透明度和及时沟通，以便尽快解决问题并恢复施工进度。
保留追究责任的权利
如果监理工程师的错误指令给施工单位造成了实际损失，施工单位有权保留追究监理工程师责任的权利。
考虑向监理单位索赔
根据相关法律规定和合同条款，施工单位也可以考虑向监理单位提出索赔，要求赔偿因错误指令导致的损失。
这些措施有助于施工单位有效应对监理工程师指令有误的情况，减少损失，并维护自身合法权益。