补办消防工程师证书的过程如下：
准备材料
身份证原件及复印件
学历证明和原证书复印件
遗失声明（市级报刊）
公安局报案证明
聘用企业的营业执照等企业资料
《注册消防工程师聘用信息登记表》
《中华人民共和国注册消防工程师职业资格证书》
有效身份证明
与现聘用单位签订的劳动合同或聘用文件、聘用证明
申请登记前三个月的社会保险证明
原工作或聘用单位出具的解聘合同、离职证明等证明材料
提交申请
携带准备好的材料，前往当地消防部门或公安消防注册办公室提交补办申请
通过电子邮件提交补办申请，邮件标题格式为“姓名+证件号码后四位+补证”，发送至指定邮箱
等待审核
消防部门会对提交的材料进行审核，确认无误后，办理新的消防工程师证件
审核通过后，消防部门将电话通知持证人，持证人需携带本人身份证原件到指定地点领取新证书
注意事项
补办证件期间，请保持电话畅通，以便消防部门与您联系
补办证件需要一定时间，请提前做好安排，以免影响工作
建议您提前准备好所有必需的材料，并咨询当地消防部门或公安消防注册办公室以获取详细的补办流程和所需材料，以确保补办过程顺利进行。