对于总监理工程师不在岗的处罚，根据相关法律法规和规定，可以采取以下措施：
警告或通告批评：
监管机构可以对不在岗的总监理工程师进行警告或通告批评。
经济处罚：
根据具体情况，可能会处以罚款。
职务调整：
视情节轻重，可能会对总监理工程师进行职务调整，如降职、停职等。
资格认证注销：
在严重情况下，可能会注销其监理工程师的资格认证。
清除出场：
清除部分监理人员出场，影响其参与工程建设。
解除监理合同：
在极端情况下，可能会终止监理合同。
刑事责任：
如果因总监理工程师不在岗造成严重后果，可能会追究刑事责任。
这些措施旨在确保工程安全和质量，并维护建筑市场的正常秩序。需要注意的是，具体的处罚措施应根据实际情况和相关法规来确定。