造价员证书的签发单位确实存在不同，主要有以下几种：
中国建筑工程总公司执业资格办公室：
该单位签发的造价员证书适用于中建系统内部，并在各局或公司间流通使用。
注册造价工程师协会：
此协会也负责造价员证书的签发，但其性质和适用范围与住建委签发的证书有所不同。
各地住房和城乡建设部门或其指定的机构：
造价员证书的签发单位通常是各地住房和城乡建设部门或其指定的机构，这些证书在全国范围内通用，但跨省使用时可能需要办理变更手续。
全国建设工程造价管理协会：
该协会也参与造价员证书的签发，并且证书上会有其贴印。
综上所述，造价员证书的签发单位不同，其适用范围和流通性也有所区别。建议根据个人所在系统或工作单位的具体情况，选择合适的证书类型，并了解相关的变更和流通规定。