监理工程师查房的内容主要包括以下几个方面：
施工进度检查
检查施工进度是否符合计划，是否存在延误或加速等情况。
施工质量检查
检查施工质量是否符合设计要求和规范标准，是否存在质量问题。
安全检查
检查施工现场是否存在安全隐患，是否符合相关安全规定。
材料检查
检查施工材料的质量和使用情况，是否符合设计要求和规范标准。
工程变更检查
检查工程变更是否经过合法程序，并且是否符合相关规定。
施工合同检查
检查施工合同是否符合法律法规和合同约定。
施工现场管理检查
检查施工现场的管理是否规范，是否存在违规行为。
工程验收检查
参与工程验收，确保工程质量符合要求。
此外，在面临调查时，监理工程师还可能涉及以下方面的内容：
职业资格和执业行为：核实监理工程师的职业资格证书是否合法有效，是否遵守了相关职业规范。
工程质量和安全：检查监理工程师是否按照法律法规和工程建设标准进行监理，是否及时发现并督促整改工程质量、安全问题。
合同履行和变更：关注是否存在合同违规操作，如未经批准的工程变更、虚假签证等。
费用控制和成本核算：核实监理工程师是否按照规定对工程费用进行了合理控制，是否存在成本核算不准确、虚报冒领等问题。
职业道德和廉洁自律：关注监理工程师是否存在收受礼金、回扣等不正当利益的行为，以及是否有违反廉洁自律规定的行为。
法律法规遵守情况：检查监理工程师在工程监理过程中，是否严格遵守了相关法律法规，如《建筑法》、《建设工程质量管理条例》等。
综上所述，监理工程师查房的内容涵盖了施工进度、质量、安全、材料、合同管理、现场管理、工程验收等多个方面，并在调查时还可能涉及职业资格、执业行为、合同履行、费用控制、职业道德和廉洁自律以及法律法规遵守情况等内容。