消防工程师违规处理流程主要包括以下几个方面：
认定与处理
地方各级考试主管部门和考试机构负责对应试人员的违纪违规行为进行认定与处理。
严重违纪违规行为由省级考试主管部门会同省级考试机构或省级考试机构进行认定与处理，并将处理情况报告人力资源社会保障部和相应行业的考试主管部门。
违纪违规行为分类
一般违纪违规行为：当次该科目考试成绩无效。
严重违纪违规行为：当次全部科目考试成绩无效，且2年内不得参加各类专业技术人员资格考试，责令离开考场。
扰乱考试秩序：不服从考试工作人员管理，责令离开考场；影响考试正常进行的，视情节轻重处理；违反《中华人民共和国治安管理处罚法》的，交由公安机关依法处理；构成犯罪的，依法追究刑事责任。
考试工作人员违规处理
一般违纪违规行为：停止其继续参加当年及下一年度考试工作，并由考试机构、考试主管部门或建议有关部门给予处分。
严重违纪违规行为：将其调离考试工作岗位，不得再从事考试工作，并给予相应处分；构成犯罪的，依法追究刑事责任。
救济权利
被处理的应试人员对处理决定不服的，可以依法申请行政复议或者提起行政诉讼。
行政处罚
警告：对轻微违法行为给予警告，提醒消防工程师遵守规定。
罚款：根据情节轻重，可处以一定数额的罚款。
暂停执业：对严重违反规定的消防工程师，可暂停其执业活动，期限一般为6个月至1年。
吊销执业资格证书：对于情节特别严重或屡教不改的消防工程师，可吊销其执业资格证书。
行业惩戒
行业内通报批评：对违反行业规范的消防工程师进行通报批评，以提高行业自律意识。
取消会员资格：对于严重违反行业规定的消防工程师，可取消其在相关行业协会的会员资格。
行业禁入：对于特别严重的违法行为，消防工程师可能会被禁止在一定期限内从事消防行业工作。
法律后果
行政责任：包括警告、罚款、没收违法所得等。
刑事责任：构成犯罪的，依法追究刑事责任。
抄告制度
公安机关消防机构对注册消防工程师作出处理决定后，应当在作出处理决定之日起七日内将违法执业事实、处理结果或者处理建议抄告原注册审批部门。原注册审批部门收到抄告后，应当依法作出责令停止执业、注销注册或者吊销注册证等处理。
建议：
消防工程师应严格遵守相关法规和规定，避免违规行为的发生。
若发现违规行为，应及时向相关部门报告，以便及时进行处理。
对于已经发生的违规行为，应积极配合相关部门的调查，并承担相应的法律责任。