监理工程师在处理工程问题时，会根据问题的性质和严重程度采取不同的措施。以下是一些常见处理方式：
提醒和警告：
对于轻微的违规行为，监理工程师可以通过提醒和警告的方式，引导监理工程师规范自己的行为。
再培训和教育：
对于不太严重的违规行为，可以通过再培训和教育的方式，帮助监理工程师更好地理解和遵守相关规定。
暂停工作：
对于严重的违规行为，可以暂停监理工程师的工作，以确保工程的质量和安全。
解除合同：
对于严重违规行为，可以解除与监理工程师的合同，并追究其法律责任。
在处理工程质量事故时，总监理工程师应签发《工程暂停令》，要求停止进行质量缺陷部位和与其有关联部位及下道工序施工，并采取必要措施防止事故扩大并保护好现场。同时，要求质量事故发生单位迅速按类别和等级向相应的主管部门上报，并于24小时内写出书面报告。监理工程师在事故调查组展开工作后，应积极协助，客观地提供相应证据。若监理方无责任，监理工程师可应邀参加调查组，参与事故调查；若监理方有责任，则应予以回避，但应配合调查组工作。接到质量事故调查组提出的技术处理意见后，监理工程师应组织相关单位研究，并责成相关单位完成技术处理方案，并予以审核签认。技术处理方案核签后，监理工程师应要求施工单位制定详细的施工方案设计，必要时应编制监理实施细则，对工程质量事故技术处理施工质量进行监理，技术处理过程中的关键部位和关键工序应进行旁站，并会同设计、建设等有关单位共同检查认可。对施工单位完工自检后报验结果，组织有关各方进行检查验收，必要时应进行处理结果鉴定。要求事故单位整理编写质量事故处理报告，并审核签认，组织将有关技术资料归档。签发《工程复工令》，恢复正常施工。
监理工程师在处理工程质量问题时的具体方法包括：
要求施工单位返工重做或进行加固处理，并重新进行验收。
对于通过返修或加固仍不能满足安全要求的检验批，应不予验收。
在审查施工进度计划的过程中发现问题，及时向承包单位提出书面修改意见，并协助其修改。
解决工作面交接和阶段成品保护责任问题、场地与公用设施利用中的矛盾问题、各承包单位之间的进度协调问题等。
监理工程师需要全面监督和管理工程施工现场，监督施工单位执行工程质量要求和安全标准，对施工单位的工作过程和验收记录进行日常监督，并及时解决工程质量问题。
这些处理方式旨在确保工程质量和安全，同时维护业主和其他相关方的利益。监理工程师在处理问题时应保持严谨、认真、客观的工作态度，并具备高度的责任心和使命感。