处理一级建造师中介问题，可以采取以下步骤：
尽快拿回证书
一级建造师应将证书尽快从中介处拿回，防止被骗。如果证书已经被中介注册，需要采取相应措施进行补救。
自我举报
向当地的住建委和建设主管部门进行举报，说明情况并提供相关证据。
直接沟通
直接与中介沟通，了解具体原因，若沟通无果，可尝试联系行业协会或法律途径解决。
报警
如果确定被中介欺骗，可以向当地公安机关报案，提供相关证据和资料，让警方介入调查。
法律途径
如果中介拒绝归还证书或涉及其他违法行为，可以通过法律途径维权，如向法院起诉要求赔偿损失。
收集证据
在整个过程中，应收集所有与中介的沟通记录、支付凭证等证据，以便在需要时提供证明。
劳动仲裁
如果证书已经被注册到某个公司，可以查询注册单位，然后去劳动仲裁要求确认已经从注册单位离职，并登报挂失。
合法程序
尝试通过合法程序解决问题，例如通过劳动局举报公司不按时支付工资，以此要求单方面解除合同。
建议：
及时行动：发现证书被中介处理后，应尽快采取行动，防止情况恶化。
收集证据：在整个过程中，务必收集所有相关证据，以便在法律程序中使用。
寻求专业帮助：如果情况复杂，建议咨询专业律师，获取更具体的法律建议和支持。