监理工程师招标代理费用的收费标准如下：
一般按照工程中标金额的1%-3%收取，具体费用双方协商确定。
通常按照工程中标金额的一定比例计算，一般是0.5%-1.5%。
有些情况下，招标代理费可能会根据中标价来计算，待中标结果出来后，根据中标价和事先约定的费率或比例来确定代理费。
招标代理服务收费采用差额定率累进计费方式，具体收费额由招标代理机构、招标委托人在规定的收费标准、浮动幅度内协商确定，最高限额为工程类项目450万元。
综上所述，监理工程师招标代理费用的收费标准主要依据工程中标金额的比例，具体费率在0.5%-3%之间，具体费用需双方协商确定。同时，也存在根据中标价来计算费用的情况，以及采用差额定率累进计费方式的可能性。建议在实际项目中，双方充分沟通，明确费用计算方式和标准，以确保项目的顺利进行。