注册消防工程师在政府单位有多种就业机会，主要包括以下几种：
消防局或应急管理局：
这些部门负责消防安全监管和管理，消防工程师可以在这里从事消防安全管理、火灾事故应急处理、消防监督检查等工作。
应急管理部：
作为全国消防工作的指导和协调机构，消防工程师可以在各级应急管理部工作，参与消防政策的制定和实施。
公安部门：
消防工程师可以在公安部门参与消防设计审核、消防监督检查、火灾事故调查等工作。
住房和城乡建设管理局：
该部门负责建设工程的消防设计审查、消防验收和监管等工作，消防工程师可以在这里发挥专业技能。
消防救援机构：
负责地方的消防安全管理、火灾事故应急处理等工作，是消防工程师的重要就业方向。
综上所述，消防工程师在政府单位的就业机会非常广泛，可以在消防局、应急管理局、应急管理部、公安部门等多个部门发挥其专业优势，从事消防安全监管、火灾事故处理、消防设计审核等相关工作。建议注册消防工程师在求职时，可以优先考虑这些政府部门和相关机构，以找到合适的岗位和发展机会。