专业监理工程师在审核分包单位资格时，需要负责以下工作：
审查分包单位的资质文件
核查分包单位的营业执照、企业资质证书、安全生产许可文件等基本资质文件是否齐全、合格且有效。
核实拟分包工程的内容和范围是否与分包单位的资质等级和营业执照相符。
人员资质审查
确认分包单位的技术人员是否持有相应的上岗证，技术人员必须持证上岗。
核查分包单位的专职管理人员是否落实到位，特种作业人员是否具有合法的资格证和上岗证。
公司业绩情况
审查分包单位的类似工程业绩，要求提供工程名称、工程质量验收等证明文件。
防止违法分包及转包行为
严格区分发包工程是否属于转包、肢解分包、层层分包等建设行为，对违法分包及转包行为一律不予认可。
实地考察
在必要时，项目监理机构（建设单位）可会同总承包单位对分包单位进行实地考察，以验证分包单位有关资料的真实性。
审核意见和审批
专业监理工程师在审查结束后，应提出审查意见，符合要求后，由总监理工程师审批并签署意见。
通过以上步骤，专业监理工程师可以确保分包单位的资格符合工程要求，从而保障工程质量和施工安全。