安全工程师管理安全时应遵循以下原则：
安全第一、预防为主、综合治理
安全第一是指在看待和处理安全与其他工作的关系时，要把安全放在首要位置。当生产和其他工作与安全发生矛盾时，必须优先考虑安全，确保不安全不生产。
预防为主强调在事故预防与事故处理的关系上，要以预防为主，防患于未然。通过管理、装备和培训等有效手段，将事故消灭在萌芽状态。
安全生产人人管理、自我管理
企业生产依靠全体职工，安全管理必须建立在广泛的群众基础之上。通过提高职工的安全意识和技能，促使其在职责范围内自觉执行安全制度和劳动纪律，自我发现、防范和控制不安全因素。
管生产必须管安全
生产和安全是密不可分的，管生产必须管安全。任何从事工艺和技术工作的工程师和技术人员，都必须在自己的业务和技术工作中充分考虑和解决相应的安全技术问题。
预防原理
通过有效的管理和技术手段，防止人的不安全行为和物的不安全状态出现，从而降低事故发生的概率。这包括偶然损失原则、因果关系原则、3E原则（工程技术对策、教育对策、法制对策）和本质化原则。
强制原理
采取强制管理的手段控制人的意愿和行动，使个人的活动、行为等受到安全管理要求的约束，从而实现有效的安全管理。这包括安全第一原则和监督原则。
系统原理
运用系统原理的原则，包括动态相关性原则、整分合原则、反馈原则和封闭原则，来管理安全生产。
人本原理
遵循动力原则、能级原则、激励原则和行为原则，以提高员工的安全意识和责任感，从而保障生产安全。
事故频发倾向理论
认为人是事故的主要原因，需要通过安全教育和培训等手段，减少人为因素导致的事故。
海因里希事故因果连锁理论
将事故因果连锁过程概括为遗传及社会环境、人的缺点、人的不安全行为或物的不安全状态、事故和伤害五个因素，强调从源头防范事故的发生。
系统安全理论
强调在事故致因理论方面，不仅关注操作人员的不安全行为，还要关注技术、管理等多个方面的因素，构建严密的安全生产治理体系。
坚持安全发展、改革创新、依法监管、源头防范和系统治理
这是安全生产领域改革发展的基本原则，要求将安全发展贯穿始终，通过改革创新、依法监管、源头防范和系统治理，确保安全生产。
这些原则为安全工程师提供了全面的指导，帮助他们在实际工作中有效地管理安全问题，确保人员和财产的安全。