消防工程师证书可以用来抵扣个人所得税。具体来说，根据《个人所得税法》及其实施细则，纳税人接受职业资格继续教育，取得相关证书的当年，可以按照每年3600元的定额扣除标准享受个人所得税专项附加扣除。这意味着，如果你在取得一级消防工程师证书的当年申报个税，你可以享受这3600元的个税抵扣额度。
需要注意的是，这项抵扣只能使用一次，即在你取得证书的当年。此外，要享受这项抵扣，你需要在每年的纳税申报时提供相关证明材料，包括一级消防工程师证书、收入证明等，以便税务部门审核并核定相应的抵扣金额。
综上所述，持有消防工程师证书的人员可以在取得证书的当年申报个税时，享受3600元的个人所得税专项附加扣除。