消防工程师主要在以下单位工作：
公安消防部门：
包括各级公安机关消防机构，负责消防安全管理、监督检查、火灾事故调查等工作。
设计院：
从事消防工程设计、施工图审核、消防设施维护等工作。
建筑工程公司：
负责消防设施的施工、安装、调试和维护等工作。
消防技术服务机构：
提供消防安全评估、消防设施检测、维护和消防安全监测等服务。
消防安全重点单位：
如商场、市场、宾馆、饭店、体育场、会堂、公共娱乐场所、医院、养老院、学校、托儿所、幼儿园、国家机关等，这些单位因涉及公共安全，火灾风险较高，需要消防工程师从事消防安全管理工作。
安检机构：
从事消防设施的安全评估、检测和验收工作。
科研院所：
从事消防技术研究和开发。
教育培训机构：
担任教师，传授消防知识，培养消防专业人才。
企业安全生产部门：
负责消防安全管理，制定和落实消防安全措施。
消防产品生产企业、 消防工程公司、 消防安全评估机构、 大型公共建筑的物业管理公司、 火灾高危行业企业等：这些单位负有消防安全责任，必须配备专业消防工程技术人员，要求相关人员持有消防工程师证。
综上所述，消防工程师在多种类型的单位中都有广泛的应用，涵盖了政府、企业、事业单位等多个领域。