当总监理工程师未能履行其职责时，可能会面临一系列的处理措施和惩罚。这些措施包括：
警告或通报批评：
首先，可能会给予警告或通报批评，以警示总监理工程师注意其职责的履行情况。
经济处罚：
可能会被处以罚款，金额根据具体情况而定，严重者可能会被处以较高数额的罚款。
人员清退：
若因总监理工程师未在岗位上而导致事故发生，则可能将其部分或全部监理人员清退出场。
资格证书吊销：
若总监理工程师的行为严重，可能会被暂停或吊销其与监理工作相关的所有资格证书，并在一定期限内不予注册。
刑事责任：
若情节特别严重，可能会触犯刑法，需要按照相关法律法规追究其刑事责任。
执业限制：
对于未能认真履行监理职责的总监理工程师，可能会被吊销注册监理工程师注册执业证书，并在一定年限内不予注册。
行政处罚：
根据具体情况，总监理工程师可能会被责令停止注册监理工程师执业一段时间，例如3个月或6个月。
这些措施旨在确保总监理工程师能够认真履行职责，保障工程质量和安全，并维护建设单位的利益。建议总监理工程师严格遵守相关规定，确保项目的顺利进行和工程的安全性。