水利部监理工程师证书的出证流程如下：
考试与证书发放
考试由中国人事考试网统一组织报名，考试合格后，将由水利部等相关主管部门颁发监理工程师资格证书。这个证书是从事水利工程监理工作的重要资质证明。
资质认可范围
根据《国家职业资格目录》和国务院的相关规定，水利工程建设监理单位资格认定由水利部实施。因此，仅由住房城乡建设部颁发的注册监理工程师，在水利行业可能不会得到认可。
证书领取时间与方式
监理工程师考试证书领取的时间一般在考试成绩公布后的3-4个月左右，具体时间因地区而异。领取方式包括现场领取和邮寄领取两种。
具体的领证时间、地点以及要求，考生需要关注当地人事考试网或水利部门发布的相关通知。例如，2024年河南省的领证时间为2024年9月24日至10月12日，领证地点为河南省水利厅。
领证所需材料
本人领取的，需提供本人有效身份证件原件及复印件；代人领取的，需提供代领人和被代领人有效身份证件原件、复印件及被代领人委托书。
电子证书
监理工程师职业资格证书（或电子证书）由人力资源社会保障部统一印制，住房和城乡建设部、交通运输部、水利部按专业类别分别与人力资源社会保障部用印，在全国范围内有效。考生可以通过中国人事考试网“证书查验”版块查验电子证书。
建议考生及时关注当地人事考试网或水利部门发布的相关通知，按照通知要求准备相关材料，按时领取监理工程师证书。