跨企业注销二级建造师的流程如下：
准备材料
个人需要准备与原聘用企业解除劳动关系的有效证明材料，如原单位解聘证明、解聘协议书、劳动仲裁书+双方送达通知书或法院判决书+生效证明等。
企业需要出具《解聘证明》或《解聘协议》，并加盖公章。
其他可能需要的材料包括个人身份证原件及复印件、二级建造师证书原件及复印件、企业法人委托书等。
提交申请
个人通过四川政务服务网或其他官方平台提出跨企业注销注册申请，并上传上述所需材料。
企业登录二级建造师注册管理系统，确认并上报个人的注销申请。
审核与公示
注册管理机构对个人提交的材料进行审核，审核通过后会在相关网站上进行公示。
公示期满无异议的，将予以注销注册，并出具注销证明。
后续事项
注销完成后，个人应密切关注审核进度，确保注销流程顺利进行。
如有需要，个人和企业可能需要配合完成其他相关手续。
建议：
在申请注销前，请确保所有材料的真实性和完整性，以便顺利通过审核。
如原聘用企业不配合提供必要材料，可以向劳动仲裁部门或法院申诉以维护自身权益，并获取解除劳动关系的证明材料。