新疆二级建造师考试科目包括以下三个：
《建设工程施工管理》：
主要考察报考者对于建设工程施工管理的基本理论、方法和技术等方面的掌握情况。
《建设工程法规及相关知识》：
主要考察报考者对于建设工程相关法律法规、政策文件以及工程合同等方面的理解和应用能力。
《专业工程管理与实务》：
这是一个专业科目，分为建筑工程、公路工程、水利水电工程、矿业工程、机电工程和市政公用工程6个专业类别。考生可以根据自己的实际需要选择其中一个专业报考。
建议考生在报考时，仔细考虑自己的兴趣和职业规划，选择最合适的专业进行报考，以便更好地通过考试并取得相应的资格证书。