消防工程师在计算楼层时，通常遵循以下方法和规则：
按自然层计算
建筑层数一般按照建筑物的自然层数计算，即从建筑物地面以上各层楼板结构标高以上的楼层数。
高度计算
建筑高度通常指建筑物室外设计地面至建筑物顶部某一平面的高度。在消防上，这一概念非常重要，因为它关系到建筑物的防火分区、疏散距离等一系列安全要求。
特殊楼层不计入
地下或半地下室：室内顶板面高出室外设计地面的高度不大于1.5米的地下或半地下室，不计入建筑层数。
建筑底部空间：设置在建筑底部且室内高度不大于2.2米的自行车库、储藏室、敞开空间，也不计入建筑层数。
屋顶突出部分：建筑屋顶上突出的局部设备用房、出屋面的楼梯间等，同样不计入建筑层数。
其他注意事项
在确定建筑层数时，还需考虑建筑物的基底面积和建筑面积是否一致。
对于住宅建筑，如果室内顶板面高出室外设计地面的高度不大于1.5米，则该空间不计入建筑层数。
这些规则在消防工程中非常重要，因为它们直接影响到建筑物的防火设计和安全疏散。在实际操作中，建议严格按照相关规范和标准进行计算，以确保建筑物的安全性。