当企业需要撤回二级建造师的申请时，通常需要遵循以下步骤：
准备材料
书面申请，说明撤回注册的原因，并由企业盖章。
相关证明材料，如新的工作合同、离职证明等，根据撤回原因而定。
提交申请
向原注册单位所在地的建设行政主管部门提交撤回申请。
如果是通过网上系统操作，可以登录“一级建造师注册管理信息系统”进行撤回。
审核材料
相关部门会对提交的材料进行审核，确认信息的完整性和合规性。
办理手续
审核通过后，根据当地规定办理相关的撤回手续，可能包括填写表格和支付费用。
完成撤回
办理完所有手续后，二级建造师的注册将被正式撤回。
请注意，撤回注册并不意味着资格证书失效，企业或个人在满足条件的情况下仍可重新申请注册。此外，撤回申请的具体流程和要求可能因地区而异，建议直接咨询当地的建设行政主管部门获取最准确的信息