监理工程师主要持有的证书有以下几种：
监理工程师执业资格证书：
这是监理工程师从事工程监理工作的必备证件，由国家建设部门颁发。
注册监理工程师证书：
该证书是监理工程师在特定领域或专业方向上的专业资格证书，由中国工程咨询协会颁发。
省级监理工程师执业资格证书：
在某些地区，监理工程师还可以获得省级颁发的执业资格证书。
监理员证：
这是针对监理员的证书，证明其具备从事监理工作的基本能力。
注册安全工程师证书：
持有此证书的人能够综合运用安全生产知识和安全管理技能，负责组织和指导工程安全监督工作。
建筑工程相关技术职称证书：
例如建筑结构工程师、建筑设备工程师等，这些证书能够证明持有人具备精通某种建筑工程技术的专业人才。
总结来说，监理工程师至少需要持有两个证书：监理工程师执业资格证书和注册监理工程师证书。此外，根据所在地区的不同，可能还可以获得省级监理工程师执业资格证书和其他相关技术职称证书。