监理工程师辞职后，其证书的处理方式主要有两种： 注销和 转注。
注销
监理工程师辞职后，若不再从事监理工作，需要向原注册单位申请注销注册，并收回注册证书和执业印章。
注销后，若需重新从事监理工作，需重新进行注册手续。
转注
监理工程师辞职后，若要到新的单位工作，其监理工程师证书可以转注到新的单位。转注需要向所在省级监理工程师管理机构提出转注申请，并提交相关材料。
转注过程中，原注册单位的注册证书和执业印章将被注销，新单位需要重新进行注册手续。
建议
注销：适用于不再从事监理工作或需要将证书用于其他用途的情况。
转注：适用于需要将证书带到新单位继续从事监理工作的情况。
根据以上信息，建议根据个人实际情况选择合适的处理方式，以确保证书的有效性和合法性。