选择二级建造师考试的科目时，可以考虑以下因素：
市场需求：
根据市场需求选择专业，可以提高通过率和未来的就业机会。建筑工程、机电工程和市政公用工程是当前较为热门的选择。
个人兴趣和职业规划：
选择自己感兴趣的专业，有利于提高学习效率和动力。同时，考虑未来的职业规划，选择与之相关的专业可以更好地为职业发展铺路。
考试难度：
从难度上来看，建筑工程相对简单一些，而市政公用工程由于涉及的知识面较广，难度较大。机电工程、公路工程和水利工程也各有其难点，具体难度可以参考学员反馈和考试通过率。
收益情况：
市场收益方面，市政工程的需求最大，也最难考，但收益也相对较高。建筑工程虽然需求量大，但相对容易考。
综合以上因素，以下是一些建议：
如果追求市场需求大且相对容易通过的专业，可以选择建筑工程或机电工程。
如果希望选择有较高市场收益且有一定难度的专业，可以选择市政公用工程。
如果对某个专业特别感兴趣或有相关的工作经验，可以选择该专业，如水利水电工程或公路工程。
最终选择哪个科目，建议结合自己的实际情况和职业规划，进行详细的评估和选择。